旱柳半胱氨酸蛋白酶基因克隆及鹽脅迫響應功能分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、旱柳是一種耐鹽耐旱的植物。本文以旱柳為材料,采用生物信息學、RT-qPCR、基因克隆等技術,得到了旱柳SmCP基因cDNA及基因組全長,分析其基因功能,得出結論如下:
  1)從旱柳cDNA文庫中篩選出一個耐鹽相關的半胱氨酸蛋白酶基因,通過PCR克隆獲得旱柳SmCP基因cDNA全長和基因組DNA全長。生物信息學軟件分析得知該基因含有8個外顯子,7個內含子,編碼359個氨基酸。同時該蛋白具有木瓜蛋白酶家族保守的結構域:inhibit

2、or-I29和peptidase-C1A,與其他木瓜蛋白酶家族一樣,N末端有1個信號肽結構,同時還有1個跨膜結構,屬于跨膜蛋白。
  2)亞細胞定位預測顯示該基因位于液泡中;進化樹分析表明該基因與毛果楊PtCP親緣關系最近。啟動子元件預測顯示該基因啟動子區(qū)包含熱脅迫、干旱脅迫、抗氧化響應元件HSE、MBS、ARE,同時還含有茉莉酸甲酯、水楊酸、生長素、赤霉素響應元件MeJA、TCA-element、TGA-element、TATC

3、-box,表明SmCP極有可能參與了這些逆境脅迫的響應。
  3)分別提取不同鹽處理時間旱柳的根莖葉的RNA,利用RT-qPCR進行旱柳SmCP組織特異性時空表達模式分析。結果顯示SmCP在旱柳根莖葉中都有表達,在葉中表達量最高,根和莖中表達量差異不大。在鹽脅迫的96小時的過程中,SmCP在根莖葉中動態(tài)表達的。莖中表達趨勢不明顯,在葉中,脅迫24h的過程中,SmCP表達量逐漸升高,24h達到巔峰值,隨后下降。在根中,表達量在48h

4、時急劇升高,在96h表達量是0h的8倍左右。
  4)構建SmCP的原核表達載體pYES2.1-SmCP,轉化大腸桿菌BL21 Star(DE3),1M NaCl脅迫條件下進行點板實驗及繪制生長曲線,結果顯示SmCP基因的轉化子生長狀態(tài)都優(yōu)于空載,證明SmCP的導入提高了大腸桿菌耐鹽性。
  5)構建的植物表達載體pCAMBIA2300-SmCP轉化農桿菌,侵染擬南芥,鑒定得到陽性表達植株。隨后對轉基因植株及野生型擬南芥鹽脅

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