1、隨著人類基因組計劃(HGP)的完成以及分子生物學等相關學科的發(fā)展，基因組學的研究重心從揭示生命的所有遺傳信息轉(zhuǎn)移到分子水平的功能研究上。后基因組學強調(diào)發(fā)展和應用整體的實驗方法，分析基因組序列信息、闡明基因功能。其任務是進行基因組功能注釋，了解基因的功能，認識基因與疾病的關系，掌握基因的產(chǎn)物及其在生命活動中的作用。生物信息學的研究重點也從基因組序列轉(zhuǎn)移到序列的生物學意義的研究上。在后基因組時代，生物信息學主要研究基因組編碼序列的轉(zhuǎn)錄、翻譯

2、的過程和結果，著重分析基因表達調(diào)控信息，分析基因及其產(chǎn)物的功能。隨著功能基因組研究的深入，產(chǎn)生了海量的生物數(shù)據(jù)。如何有效地利用這些數(shù)據(jù)，研究基因的表達調(diào)控機制，研究基因在生物體代謝途徑中的地位，分析基因、基因產(chǎn)物之間的相互作用關系，已經(jīng)成為生物信息學在功能基因組學研究的重要任務。 生物信息學是處理生物分子信息、揭示生物分子信息內(nèi)涵的一種技術，它在基因芯片研究與應用中起著重要的作用。從確定基因芯片檢測對象到基因芯片設計，從芯片檢測

3、結果分析到實驗數(shù)據(jù)管理和信息挖掘，無不需要生物信息學的支持和幫助。 生物信息學現(xiàn)有的許多方法都可以直接應用于基因芯片，如序列比較方法、片段組裝方法、聚類方法等。然而，基因芯片研究與應用又對生物信息學提出了許多新的問題。數(shù)據(jù)挖掘問題就是其中之一?；蛐酒a(chǎn)生的數(shù)據(jù)相當多，并且與其他數(shù)據(jù)有關聯(lián)，如何分析這些數(shù)據(jù)之間的關系、挖掘其中的知識，是一個十分重要的問題，而目前生物信息學中數(shù)據(jù)挖掘也是一個有待發(fā)展的研究方向。 目前，基

4、因芯片的數(shù)據(jù)挖掘已成為生物信息學研究的熱點之一，引起了廣泛的重視。特別是高密度的DNA微陣列，由于其荷載了成千上萬個DNA片段，可用于高通量的生物學檢測，其開發(fā)和利用已進入商業(yè)化階段，而其數(shù)據(jù)處理和數(shù)據(jù)挖掘更受關注。鑒于此，我們開發(fā)了一個處理和分析基因芯片數(shù)據(jù)的完全自動化的系統(tǒng)DC_CLLISTER。文中的第五章詳細介紹了用C/C++語言編碼的DC CLUSTER系統(tǒng)的總體設計流程，從軟件系統(tǒng)結構、數(shù)據(jù)文件的格式、基因表達譜聚類分析、基