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文檔簡介
1、隨著研究者對疾病和基因之間關系的探討性研究,兩者間的關聯(lián)逐漸為人們所認知,尤其相關技術的發(fā)展更是極大促進了研究的深入,比如基因測序技術。隨著高通量測序技術的不斷發(fā)展,研究者們可以獲取更多更直接的編碼和非編碼物質(zhì)在人類疾病中表達的數(shù)據(jù)。由于調(diào)控人類發(fā)育的編碼物質(zhì)數(shù)量巨大,如當前基因樣本數(shù)高達兩萬多維,隨著維數(shù)的增加,獲取關鍵基因的難度也隨之增加。近年來關于基因和疾病之間的成果越來越多,研究者們發(fā)現(xiàn)眾多種疾病間存在很多共性,比如某些基因在多
2、種疾病中都有相似的表達,因此需要通過一定方法鑒別與多種疾病相關的基因,從而探討基因之間的聯(lián)系,研究更深層次的疾病網(wǎng)絡問題,此背景下PanCancer項目應運而生,用于研究多種疾病間聯(lián)系的問題。
本文針對復雜疾病和基因之間的關系進行了研究,以PanCancer項目給出的數(shù)據(jù)為對象,基于miRN A和基因之間的靶定關系,提出了一種利用miRN A發(fā)現(xiàn)疾病相關基因的方法,避免了直接分析高維基因表達數(shù)據(jù)的不便。論文取得的創(chuàng)新性成果如下
3、:
1.提出了一種利用miRNA發(fā)現(xiàn)復雜疾病相關基因的方法,miTOm(miRNA TO mRNA)。miTOm通過分析低維的miRNA數(shù)據(jù),再結合miRNA和基因間的靶定關系,進而發(fā)現(xiàn)復雜疾病的相關基因,可以避免直接分析高維的mRN A基因表達數(shù)據(jù)。
2.將提出的方法用于PanCancer項目的數(shù)據(jù)分析。首先利用miTOm分析了PanCancer中的幾種單一癌癥的樣本數(shù)據(jù),接著對六種癌癥樣本合成的組合數(shù)據(jù)進行了共性
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