大鼠肝再生相關lncRNA對大鼠肝細胞株BRL-3A增殖的作用研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、近些年來,研究證明lncRNA能夠調控多種生理和病理進程,包括對大鼠肝再生的調控。但是lncRNA對肝再生的調控機制還不清楚。為了了解lncRNA是如何調控肝再生,本研究采用高通量測序、RT-PCR檢測大鼠2/3肝切除誘導的肝再生3個時間點肝細胞中表達有意義的lncRNA。結果表明在大鼠肝再生3個時間點肝細胞中表達變化有意義的lncRNA有770條,其中差異表達的lncRNA有28條。分析在肝再生中有意義表達的lncRNA的具體表達情況

2、,發(fā)現(xiàn)有254條表達發(fā)生上調,464條表達下調,52條表達上/下調。差異表達的28條lncRNA中13條表達上調,12條表達下調,3條表達上/下調。為了解這些差異表達的lncRNA對肝再生的調節(jié)作用,采用生物信息學方法預測其靶基因,結果表明lncRNA的共表達(TRANS作用)基因中表達差異的465條。lncRNA的調控(CIS作用)基因差異表達的10條。為進一步篩選出待研究的lncRNA及其在肝再生中的作用,用DESeq,結合GO和K

3、EGG信息分析基因功能發(fā)現(xiàn)基因在細胞中具有多種作用。用Ingenuity中的Ingenuity Pathway Analysis(IPA)檢測大鼠肝再生不同時間點差異表達的基因相應的蛋白質在細胞中作用,結果顯示相關基因在細胞生長、增殖、分化、細胞通訊、信號傳導、分子運輸、細胞增殖、作為信號分子等方面具有一定的調控作用。IPA分析信號通路發(fā)現(xiàn)差異表達lncRNA的靶基因主要參與的信號通路有ILK通路、ERK/MAPK通路、SAPK/JNK

4、 Signaling通路等。
  本文從差異表達lncRNA中篩選其中的兩個并研究其對肝細胞增殖的調控作用。高通量測序結果表明lncRNA TCONS_00027980和TCONS_00042303在肝再生不同時間點表達水平顯著變化,RT-PCR檢測不同時間點再生肝組織中兩種lncRNA的RNA表達水平,實驗結果表明高通量測序結果是可信的。本文首先用干涉技術降低lncRNA在大鼠BRL-3A細胞中的表達水平,MTT法檢測BRL-3

5、A細胞的活性,流式細胞術檢測BRL-3A增殖情況的變化,RT-PCR和Western-blot用來檢測與增殖相關基因的表達情況。檢測結果表明MTT法檢測表明實驗組比對照組細胞活性增加(P<0.05);流式細胞術實驗檢測顯示與對照組相比,實驗組的S+G2/M期細胞數(shù)在一定程度上增加了(P<0.05);而real-time PCR(RT-PCR)檢測mRNA表達水平,結果表明實驗組與對照組相比,細胞增殖相關基因MYC、CCNA2、CCND1

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